Bioinformatiker­(m/w/d)

Über diesen Job

Werde Teil des Modellvorhabens Genomsequenzierung und unterstütze die Universitätsmedizin in der Schnittstellenfunktion zwischen Pathologie und Medizininformatik. In dieser Vollzeitstelle (38,5 Stunden/Woche) hast du die Möglichkeit, Sequenzierungsdaten eigenständig zu analysieren und bioinformatische Analysepipelines weiterzuentwickeln. Du bringst ein abgeschlossenes Studium in (Medizin-/Bio-) Informatik sowie fundierte Kenntnisse in der NGS-Datenanalyse mit und profitierst von einer attraktiven Vergütung bis zur Entgeltgruppe 13. Starte zum nächstmöglichen Zeitpunkt in ein engagiertes Team mit flexibler Einarbeitung und Entwicklungsmöglichkeiten.

Aufgaben

• Mitarbeit im Modellvorhaben Genomsequenzierung in enger Zusammenarbeit mit klinischen und wissenschaftlichen Partnern
• Schnittstellenfunktion zwischen Pathologie und Medizininformatik innerhalb der Universitätsmedizin, Teilnahme an Tumorboards
• Eigenständige Analyse von Sequenzierungsdaten, insbesondere Genpanel, WES und WGS
• Anpassung und Anwendung bioinformatischer Analysepipelines einschließlich Unterstützung bei der Etablierung und Weiterentwicklung von Workflows für die genomische Diagnostik
• Interpretation und Aufbereitung der Analyseergebnisse für die weitere Befunderstellung
• Dokumentation der Analysen sowie Mitwirkung an Qualitätssicherungsmaßnahmen

Anforderungen

• Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium in (Medizin-/Bio-) Informatik oder verwandten Fachgebieten
• Fundierte Kenntnisse in der Analyse von NGS-Daten, einschließlich RNA-Seq, WES und WGS
• Erfahrung im Umgang mit bioinformatischen Tools und Pipelines wie sarek, strelka, cnvkit, DRAGEN
• Sehr gute Programmierkenntnisse in Programmiersprachen wie Python und R
• Kenntnisse im Umgang mit Linux-Umgebungen und Datenbanktechnologien
• Erfahrung mit gängigen Datenintegrationswerkzeugen und Datenformaten wie FASTQ, BAM, VCF
• Kenntnisse medizinischer Standards und Schnittstellen wie HL7
• Ausgeprägte Fähigkeit zum selbständigen, strukturierten und lösungsorientierten Arbeiten
• Hohe Kommunikations- und Teamfähigkeit sowie Bereitschaft zur interdisziplinären Zusammenarbeit
• Sehr gute Deutsch- und Englischkenntnisse in Wort und Schrift

Benefits

• Attraktive Vergütung
• Betriebliche Altersvorsorge
• 30 Tage Erholungsurlaub
• Vermögenswirksame Leistungen
• Flexible Einarbeitungsphase

Kontakt

Tel: 03455570

Email: personal@uk-halle.de