PhD/PostdoctoralResearcher(m/f/d)inBioinformatics,MicrobialGenomics,andInfectiousDiseaseResearch-InstituteofMedicalMicrobiologyandHospitalHygiene
Über diesen Job
Die Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg sucht einen Bioinformatiker (m/w/d) für die Entwicklung und Anwendung bioinformatischer Methoden zur Analyse klinischer und mikrobieller Sequenzierungsdaten im Rahmen des RED-MED Projekts. Sie bringen ein relevantes Hochschulstudium und Erfahrung in der Analyse von Next-Generation Sequencing-Daten mit und arbeiten in einem interdisziplinären Forschungsteam. Neben einem attraktiven Arbeitsplatz in der Medizinischen Fakultät erwarten Sie umfangreiche Fortbildungsmöglichkeiten sowie ein attraktives Gehalt nach TV-L E 13. Bewerbungen sind bis zum 21.08.2026 möglich.
Aufgaben
- Analyse von Sequenzierungsdaten mit kurzen und langen Reads (Illumina und Oxford Nanopore)
- Entwicklung und Optimierung von reproduzierbaren bioinformatischen Workflows und computergestützten Methoden
- Durchführung mikrobiologischer genomischer Analysen, einschließlich vergleichender Genomik, Phylogenie, pathogenen Evolutionen und mcfDNA-basierter Pathogenerkennung
- Benchmarking und Optimierung bioinformatischer Werkzeuge und computergestützter Ansätze
- Integration von genomischen, mikrobiologischen und klinischen Daten
- Zusammenarbeit innerhalb eines interdisziplinären Forschungsteams und Verbreitung von Forschungsergebnissen durch wissenschaftliche Publikationen und Konferenzen
Anforderungen
- Du hast einen Doktortitel in Bioinformatik, Computational Biology, Data Science oder Mikrobiologie oder einen Masterabschluss im relevanten Bereich.
- Du verfügst über Erfahrung in der Analyse von Next-Generation-Sequenzierungsdaten und bioinformatischen Workflows.
- Du hast Programmier- oder Skriptingkenntnisse in Python, R, Bash, Perl oder ähnlichen Sprachen und bist mit Linux-Umgebungen vertraut.
- Du kennst dich mit der Analyse von Mikrobiom-Daten, phylogenetischen Analysen und metagenomischen Studien aus.
- Du bist vertraut mit Illumina- und/oder Oxford Nanopore-Sequenzierungstechniken und deren Anwendungsbereichen.
- Du hast fundierte analytische Fähigkeiten und ausgezeichnete Problemlösungsfähigkeiten, um komplexe Daten zu interpretieren.
- Du kannst sowohl selbstständig als auch im Team arbeiten und bist kommunikativ in Englisch, schriftlich sowie mündlich.
- Du hast Kenntnisse über mikrobiologische Genomik, Pathogenetik und antimikrobielle Resistenzen sowie verwandte Fachgebiete.
Benefits
- Interessante Arbeitsumgebung
- Weiterbildungs- und Schulungsmöglichkeiten
- Ermäßigte Fahrkarten für Bus und Bahn
- Sport- und Entspannungsangebote
- Onboarding-Event
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