Doktorand­(m/w/d)­/­Postdoktorand­(m/w/d)­im­Bereich­Bioinformatik,­Mikrobielle­Genomik­und­Infektionsforschung­im­RED-MED-ProjektInstitut­für­Medi

Universitätsklinikum Magdeburg A.ö.R.
39120 Magdeburg
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Über diesen Job

Werden Sie Teil des interdisziplinären Teams an der Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg als Postdoktorand (m/w/d) oder Doktorand (m/w/d) im Bereich Bioinformatik. Sie unterstützen die Entwicklung bioinformatischer Methoden zur Analyse mikrobieller Sequenzierungsdaten und tragen zur Infektionsforschung bei. Voraussetzung ist eine Promotion oder ein Masterabschluss in einem relevanten Fachgebiet sowie Erfahrung in der Analyse von Next-Generation-Sequenzierungsdaten. Freuen Sie sich auf ein attraktives Arbeitsumfeld mit umfassenden Fortbildungsmöglichkeiten und einer leistungsgerechten Vergütung. Bewerben Sie sich bis zum 21.08.2026!

Aufgaben

  • Analyse von Kurz- und Langsequenzierungsdaten (Illumina und Oxford Nanopore) durchführen
  • Entwicklung und Optimierung reproduzierbarer bioinformatischer Workflows und computergestützter Methoden vornehmen
  • Mikrobielle Genomanalysen einschließlich vergleichender Genomik, Phylogenetik, Pathogenevolution und mcfDNA-basierter Pathogendetektion durchführen
  • Benchmarking und Optimierung bioinformatischer Werkzeuge und computergestützter Methoden durchführen
  • Integration genomischer, mikrobiologischer und klinischer Daten vornehmen
  • Zusammenarbeit in einem interdisziplinären Team
  • Wissenschaftliche Ergebnisse in Fachzeitschriften veröffentlichen
  • Wissenschaftliche Ergebnisse auf Konferenzen präsentieren

Anforderungen

  • Du hast Erfahrung in der Analyse von Next-Generation-Sequenzierungsdaten, insbesondere mit Illumina und Oxford Nanopore Technologien.
  • Du bist versiert im Umgang mit bioinformatischen Workflows und hast Kenntnisse in der Workflow-Entwicklung.
  • Du besitzt Programmier- und Skriptkenntnisse in Sprachen wie Python, R, Bash oder Perl sowie Erfahrung mit Linux-basierten Systemen.
  • Du hast Kenntnisse in mikrobieller Genomik und verwandten Bereichen, einschließlich Phylogenetik und Metagenomik.
  • Du verfügst über umfangreiche analytische Fähigkeiten und eine selbstständige, teamorientierte Arbeitsweise.
  • Du hast Erfahrung mit hochperformanten Rechenumgebungen (HPC) und der Analyse antimikrobieller Resistenzen.
  • Du bist in der Lage, genetische, mikrobiologische und klinische Daten zu integrieren und zu analysieren.
  • Du hast sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift und bist kommunikationsstark in einem interdisziplinären Team.

Benefits

  • Interne Fortbildungsangebote
  • Externe Fortbildungsangebote
  • Jobticket
  • Betriebliches Gesundheitsmanagement
  • Onboarding-Veranstaltung
  • Leistungsgerechte Vergütung

Kontakt

Herr Prof. Dr. Achim Kaasch

Tel: 00493916713392

Email:

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