PostdoctoralResearcher(f/m/d)inthefieldofDeepLearningforthecerealGeneRegulation{Bioinformatiker/in}
Über diesen Job
Postdoktorand (f/m/d) im Bereich Deep Learning für die Genregulation von Getreide gesucht! Das Leibniz-Institut für Pflanzen-genetik und Kulturpflanzenforschung (IPK) bietet eine spannende Möglichkeit, um innovative Modelle zu entwickeln und die Funktionalität regulatorischer Sequenzen in Weizen und Gerste zu erforschen. Sie arbeiten in einem dynamischen internationalen Team, haben Zugang zu modernen Einrichtungen und profitieren von flexiblen Arbeitsbedingungen. Bewerben Sie sich bis zum 22.07.2026 und gestalten Sie die Zukunft der Pflanzenforschung aktiv mit!
Aufgaben
- Deep-Learning-Modelle entwerfen, trainieren und interpretieren, um regulatorische Sequenzeigenschaften in den Genomen von Gerste und Weizen abzuleiten.
- Genomassemblierungen, WGS-Variantendaten und umfassende RNA-seq-Daten integrieren.
- Den funktionalen Einfluss von regulatorischen Sequenzvariationen (SNPs, Indels, SVs) quantifizieren und die Ergebnisse mit GWAS- und Trait-Daten integrieren.
- Zur Open RegulomeAtlas-Ressource beitragen und Ergebnisse über REST- und BrAPI-kompatible APIs bereitstellen.
- FAIR Datenmanagement sicherstellen und eng mit Genetikern, Züchtern und Industriepartnern zusammenarbeiten.
- Forschungsergebnisse in hochrangigen Fachzeitschriften veröffentlichen.
- Eng mit Projektpartnern zusammenarbeiten, MSc/PhD-Studierende betreuen und zu neuen Förderanträgen beitragen.
Anforderungen
- Du hast einen Doktortitel in Bioinformatik, computerbasierten Biowissenschaften oder Genomik
- Du hast nachweisliche Expertise in Deep Learning und statistischer Modellierung von biologischen Sequenzdaten
- Erfahrungen mit genomischen und transkriptomischen Daten, insbesondere RNA-seq
- Familiarität mit cis-regulatorischen Elementen und Genregulation ist von Vorteil
- Vertrautheit mit HPC-Umgebungen und Versionskontrolle
- Gute Kenntnisse der FAIR-Datenmanagementprinzipien
- Exzellente Englischkenntnisse in Kommunikation und ein starkes Publikationsrekord
- Starkes Interesse an Pflanzen-Genomik, Genregulation und Deep Learning
- Hohe wissenschaftliche Neugier und Motivation
- Fähigkeit zur autonomen und teamorientierten Arbeit
Benefits
- Dynamisches Forschungsumfeld
- Internationale Zusammenarbeit
- Flache Hierarchien
- Familienfreundliche Arbeitsbedingungen
- Flexible Arbeitszeiten
- Berufliche Weiterbildung
- Attraktives Gehalt
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