Doktorand(m/w/d)/Postdoktorand(m/w/d)imBereichBioinformatik,MikrobielleGenomikundInfektionsforschungimRED-MED-Projekt–InstitutfürMedizinischeMikrobiologieundKrankenhaushygiene
Über diesen Job
Die Otto-von-Guericke-Universität Magdeburg sucht einen engagierten Postdoktoranden oder Doktoranden (m/w/d) zur Mitarbeit an bioinformatischen Methoden zur Analyse klinischer und mikrobieller Sequenzierungsdaten. Zu den Aufgaben gehören die Entwicklung von Workflows, mikrobielle Genomanalysen und die Zusammenarbeit in einem interdisziplinären Team. Voraussetzungen sind ein relevanter akademischer Abschluss, Erfahrung in der Analyse von Sequenzierungsdaten sowie Programmierkenntnisse. Geboten werden ein spannender Arbeitsplatz, Weiterbildungsmöglichkeiten und eine leistungsgerechte Vergütung. Bewerbungen sind bis zum 21.08.2026 möglich.
Aufgaben
- Analyse von Kurz- und Langsequenzierungsdaten (Illumina und Oxford Nanopore)
- Entwicklung und Optimierung reproduzierbarer bioinformatischer Workflows und computergestützter Methoden
- Durchführung mikrobieller Genomanalysen einschließlich vergleichender Genomik, Phylogenetik, Pathogenevolution und mcfDNA-basierter Pathogendetektion
- Benchmarking und Optimierung bioinformatischer Werkzeuge und computergestützter Methoden
- Integration genomischer, mikrobiologischer und klinischer Daten
- Zusammenarbeit in einem interdisziplinären Team
- Veröffentlichung wissenschaftlicher Ergebnisse in Fachzeitschriften
- Präsentation auf wissenschaftlichen Konferenzen
Anforderungen
- Promotion oder einschlägiger Masterabschluss in Bioinformatik, Computational Biology, Data Science oder Mikrobiologie erforderlich
- Erfahrung in der Analyse von Next-Generation-Sequenzierungsdaten und bioinformatischen Workflows
- Programmierkenntnisse in Python, R, Bash oder Perl sowie Erfahrung mit Linux-Umgebungen notwendig
- Kenntnisse in mikrobieller Genomik und verwandten Bereichen wie Phylogenetik und Metagenomik von Vorteil
- Ausgeprägte analytische Fähigkeiten und selbstständige, teamorientierte Arbeitsweise gefordert
- Sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift erforderlich
Benefits
- Interne Fort- und Weiterbildungsangebote
- Externes Fortbildungsangebot
- Jobticket
- Betriebliches Gesundheitsmanagement
- Einführungsveranstaltung
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