Informatiker­/­Medizininformatiker­/­Bioinformatiker­(m/w/d)­im­Datenintegrationszentrum­und­Biobank­der­UMH

Über diesen Job

Gestalten Sie die Biobank der Zukunft am Universitätsklinikum Halle (Saale) mit! In Teilzeit (30 Stunden/Woche, befristet bis zum 31.12.2027) arbeiten Sie an der Konzeption und Implementierung von Schnittstellen für die interoperable Nutzung bioprobenbezogener Daten. Sie bringen einen wissenschaftlichen Abschluss in Informatik oder einem verwandten Fach mit und verfügen über Kenntnisse in Medizininformatik-Standards sowie Datenbanken. Profitieren Sie von einer attraktiven Vergütung, 30 Tagen Erholungsurlaub und individuellen Entwicklungsmöglichkeiten.

Aufgaben

• Konzeption, Implementierung und Betreuung von Schnittstellen auf Basis von HL7 FHIR zwischen der lokalen Biobank und dem Datenintegrationszentrum an der UMH
• Unterstützung bei der Anwendungsbetreuung des Bioprobeninformationssystems CentraXX
• Technische Integration zwischen Biobank-Systemen, insbesondere CentraXX, und klinischen bzw. forschungsbezogenen IT-Systemen
• Aufbereitung und Überführung bioprobenbezogener (Meta-) Daten in ein zentrales FHIR-Repository unter Anwendung geeigneter ETL-Prozesse und Datenstandards
• Integration der bioprobenbezogener (Meta-) Daten in die durch das Netzwerk vorgegebenen zentralen Strukturen
• Implementierung von Validierungs- und Transformationsmechanismen zur Gewährleistung konsistenter, standardisierter Daten (z. B. HL7 FHIR) sowie Unterstützung der interoperablen Nutzung innerhalb klinischer IT-Systeme
• Enge Kooperation mit Anwendungs- und Netzwerkspezialisten sowie klinischen Forschern

Anforderungen

• Sie haben einen wissenschaftlichen Fach- oder Hochschulabschluss in Informatik oder im naturwissenschaftlichen Bereich.
• Sie verfügen über gute Kenntnisse relevanter Medizininformatik-Standards wie HL7, FHIR, LOINC und SNOMED.
• Sie sind erfahren im Umgang mit Datenbanken, insbesondere MS-SQL und MySQL, sowie gängigen Programmiersprachen wie Python und SQL.
• Sie besitzen Kenntnisse in der Entwicklung und Nutzung von Webschnittstellen, einschließlich REST, JSON und HTTP.
• Sie haben Erfahrung mit Tools wie Postman zur API-Testung und -Integration.
• Sie sind in der Lage, strukturiert und eigenständig zu arbeiten und zeigen Teamfähigkeit.
• Sie sprechen fließend Deutsch, mindestens auf dem Niveau C1.
• Sie haben Erfahrungen in der Zusammenarbeit mit klinischen Forschern und Anwendungs- bzw. Netzwerkspezialisten.
• Sie verstehen ETL-Prozesse und sind in der Lage, bioprobenbezogene Daten in zentrale Repositories zu überführen.
• Sie sind in der Lage, Validierungs- und Transformationsmechanismen für konsistente Daten zu implementieren.

Benefits

• Attraktive Vergütung
• Betriebliche Altersvorsorge
• 30 Tage Erholungsurlaub
• Vermögenswirksame Leistungen
• Qualifizierte Einarbeitung
• Digitales Informationsportal
• Interactive Willkommenstour

Kontakt

Tel: +493455570

Email: personal@uk-halle.de