PostdoctoralResearcher(f/m/d)inthefieldofDeepLearningforthecerealGeneRegulation
Über diesen Job
Das Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK) sucht einen Postdoctoral Researcher (f/m/d) im Bereich Deep Learning für die Genregulation von Getreide. In einem dynamischen Forschungsumfeld werden Sie tiefes Lernen und Netzwerkanalysen anwenden, um regulatorische Varianten in Weizen und Gerste zu identifizieren. Erforderlich sind ein PhD in Bioinformatik oder verwandten Bereichen sowie Erfahrung mit tiefem Lernen und genomischen Daten. Das Projekt bietet eine internationale Teamatmosphäre, flexible Arbeitszeiten und ein Gehalt bis zu 100 % E13 TV-L. Bewerbungen sind bis zum 22. Juli 2026 möglich.
Aufgaben
- Deep-Learning-Modelle entwerfen, trainieren und interpretieren, um regulatorische Sequenzmerkmale in Gerste und Weizen zu erfassen.
- Genomassemblies, WGS-Variantencalls und großangelegte RNA-seq-Daten integrieren.
- Die funktionale Auswirkung von regulatorischer Sequenzvariation (SNPs, Indels, SVs) quantifizieren und die Ergebnisse mit GWAS- und Trait-Daten integrieren.
- Zur offenen RegulomeAtlas-Ressource beitragen und Ergebnisse über REST- und BrAPI-kompatible APIs bereitstellen.
- FAIR-Datenmanagement sicherstellen und eng mit Genetikern, Züchtern und Industriepartnern zusammenarbeiten.
- Ergebnisse in hochrangigen Fachzeitschriften veröffentlichen.
- Eng mit Projektpartnern zusammenarbeiten und MSc/PhD-Studierende betreuen.
- Zu neuen Förderanträgen beitragen.
Anforderungen
- Du hast eine Promotion in Bioinformatik, Rechenbiologie, Genomik oder einem verwandten Bereich abgeschlossen.
- Du verfügst über nachweisliche Erfahrung in Deep Learning und statistischer Modellierung biologischer Sequenzdaten wie genomischen und transkriptomischen Daten.
- Du hast Erfahrung mit genomischen und transkriptomischen (RNA-seq) Daten und kennst dich mit cis-regulatorischen Elementen und Genregulation aus.
- Du bist sicher im Umgang mit HPC-Umgebungen, Versionskontrolle und den FAIR-Prinzipien für Datenmanagement.
- Du kommunizierst exzellent auf Englisch und hast eine starke Publikationshistorie in wissenschaftlichen Fachzeitschriften.
- Du hast ein starkes Interesse an Pflanzen-Genomik, Genregulation und Deep Learning.
- Du zeichnest dich durch wissenschaftliche Neugier und Motivation aus und arbeitest sowohl autonom als auch im Team.
Benefits
- Dynamisches Forschungsumfeld
- Persönliche Entwicklungsmöglichkeiten
- Interdisziplinäres Team
- Flache Hierarchien
- Kollegiale Atmosphäre
- Work-Life-Balance
- Flexible Arbeitszeiten
- Familienfreundliche Arbeitsbedingungen
- Karriere und Familie Zertifikat
Ist dir ein Fehler aufgefallen?
Teile uns mit, was nicht funktioniert hat, damit wir es schnell beheben können. Sende eine E-Mail an fachkraefte(at)img-sachsen-anhalt.de